Kimia Medisinal "PHARMACOPHORE"

“PHARMACOPHORE”

Farmakofor adalah susunan tiga dimensi dari atom dalam molekul obat yang memungkinkanuntuk berikatan dengan reseptor yang diinginkannya dan bertanggung jawab dengan respon biologis karena terikat dengan reseptor yang dikehendakinya

 IDENTIFIKASI PHARMACOPHORE

·         Menentukan gugus molekul yang akan berikatan dengan reseptor

·         Menentukan  posisi relatif dari kelompok pengikat obat dengan reseptor

·         Perlu diketahui konformasi aktif  dari molekul obat

·         Penting untuk desain obat  

·          Penting untuk penemuan obat

FUNGSI PHARMACOPHORE

Farmakope juga digunakan sebagai titik awal untuk mengembangkan model 3DQSAR . Alat-alat semacam itu dan konsep terkait "struktur istimewa", yang "didefinisikan sebagai kerangka kerja molekuler yang mampu menyediakan ligan yang berguna untuk lebih dari satu jenis target reseptor atau enzim dengan modifikasi struktural yang bagus

STRUCTURAL (2D) PHARMACOPHORE

Mendefinisikan kerangka minimum yang menghubungkan kelompok pengikat penting

Contoh :

1.      Morphine 

2.      Metazocine

3.      Leporphanol 

Kelompok penting untuk aktivitas analgesik

3D PHARMACOPHORE
Mendefinisikan posisi relatif di ruang kelompok pengikat penting

A.IKATAN KOVALEN

            Ikatan kovalen terbentuk bila ada dua atom sling menggunakan sepasang elektron secara bersa sama. Ikatan ini merupakan ikatan yang paling kuat dengan rata rata kekuatan ikatan 100 kkal/mol. Pada suhu normal ikatan bersifat ireversibel dan hanya dapat pecah bila ada pengaruh katalisator enzim tertentu. Umumnya ikatan ini digunakan untuk tujuan terapi tertentu like as antibacterial and anticancer

Contoh Obat yang mekanisme kerjanya melibatkan ikatan kovalen diantaranya :

1. Turunan nitrogen mustar

   Adalah senyawa pengalkilasi yang pada umumnya digunakan sebagai obat antikanker. Contoh obatnya :mekloretamin, siklofosfamid,klorambusil dan tiotepa.

2. Turunan antibiotika beta lactam

   Turunan ini seperti obat golongan penisilin dan sefalosporin yang mengandung cincin beta lactam yang merupakan senyawa pengasilasi kuat dan mempunyai kespesifikan tinggi terhadap gugus amino serin dari enzim transpeptidase yaitu enzim yang mengkatalisis tahap akhir sintesis dinding sel.

3. Senyawa organofosfat

   Senyawa organofosfat suatu insektisida dapat berinteraksi dengan gugus serin yang merupakan bagian fungsional dari sisi aktif enzim asetilkolinesterase.Sehingga dapat menyebabkan penumpukann asetilkolin yang bersifat toksik pada serangga.

4. Senyawa asam organik dan Hg organik

5. Senyawa etakrinat

B. IKATAN ION

            Ikatan ion adalah ikatan yang dihasilkan oleh daya tarik menarik elektrostatik antara ion ion yang muatannya berlawanan. Kekuatan tarik menarik akan makin berkurang bila jarak antar ion makin jauh dan pengurangan tersebut berbanding terbalik dengan jaraknya.

C.IKATAN HIGROGEN

            Adalah suatu ikatan antara atom H yang mempunyai muatan positif parsial dengan atom lain yang bersifat elektronegatif dan mempunyai sepasang elektron bebas dengan oktet lengkap seperti O, N, dan F. Adapun contoh turunan obat yang mengalami perubahan akibat adanya ikatan hidrogen :

Turunan pirazolon, Turunan asam hidroksi benzoat, Turunan ester asam hidroksikalboksilat, Tunrunan benzotiadiazin dan sulfonamidbenzoat.

D.IKATAN VAN DER WALLS

            Merupakan kekuatan tarik menarik antar molekul atau atom yang tidak bermuatan dan letaknya berdekatan atau jaraknya + 4-6A .Ikatan ini terjadi karena sifat kepolarisasian molekul suatu atom.

GENERALIZED BONDING TYPE PHARMACOPHORE

Mendefinisikan posisi relatif di ruang interaksi penting yang penting yang diperlukan untuk aktivitas Akseptor ikatan hidrogen Donor ikatan hidrogen interaksi van der Waals Interaksi ionik

KONFORMASI AKTIF

·      Konformasi diadopsi oleh obat ketika berikatan dengan target

·      Identifikasi konformasi aktif untuk mengidentifikasi farmakofor 3D

·      Konformasi analisi sulit untuk molekul fleksibel dengan sejumlah besar konformasi

·      Lebih mudah membandingkan aktifitas dari analog rigid

·      Konformasi analisis identifikasi konformasi possitif dan stabilitas 

REFERENSI

1.     https://en.wikipedia.org/wiki/Pharmacophore

2.     https://www.scribd.com/document/342747238/Farmakofor-adalah-susunan-tiga-dimensi-dari-atom-dalam-molekul-obat-yang-memungkinkan-untuk-berikatan-dengan-reseptor-yang-diinginkannya-dan-bertanggu 

3.     http://fahrunnisapartone.blogspot.co.id/2015/03/hubungan-struktur-ikatan-dan-aktivitas.html

PERTANYAAN

1. Berikan contoh dari pharmacophore 3D ?

2. Apa yang dimaksud konformasi aktif  ?

3. Sebutkan tujuan/fungsi dari konformasi aktif?

4. Apakah konformasi aktif dan bioaktif sama ? tolong jelaskan .

5. Sebutkan type ikatan dari pharmacophore?

6. Berikan contoh ikatan ion dan ikatan van der walls?

7.  Apa tujuan pharmacophore dalam bidang farmasi ?
8. mengapa pharmacophore penting untuk diketahui?